(1) ekipamenduen hautaketa. Farmazia-ekipoen aukeraketan arazo batzuk daude, hala nola esperientziaren araberako hautaketa (benetako kalkulurik gabe edo datuen kalkulu nahikorik gabe), aurrerapenaren bilaketa itsua eta datu fisikoen ikerketa nahikorik ez egitea, eta horrek ekipamenduaren praktikotasunean eta ekonomian eragin handia du.

(2) ekipamenduen instalazioa eta prestakuntza. Farmazia-ekipoen instalazio-prozesuan, eraikuntzaren aurrerapenari erreparatzen zaio askotan, eraikuntzaren kalitatea alde batera utzita, eta horrek ekipamenduen mantentze-kostuak handitzea dakar geroago. Horrez gain, ekipamenduen mantentze-lanetarako eta funtzionamendurako langileen prestakuntza desegokiak arriskuak ere sortzen ditu farmazia-ekipoen kudeaketarako eta mantentze-lanetarako.

(3) informatizazioaren kudeaketan eta mantentze-lanetan inbertsio eskasa. Gaur egun, enpresa askok ekipamenduen kudeaketari eta mantentze-lanei garrantzi handia ematen dioten arren, baita ekipamenduen mantentze-lanen erregistroen kudeaketari eta oinarrizko parametroen erregistroari eta batzuk eginda ere, oraindik ere arazo batzuk daude, hala nola mantentze-lanen datuak jarraitzeko zailtasuna, ekipamendu farmazeutikoen zehaztapenen informazio eraginkorrik eza, hala nola zehaztapenak, marrazkiak, etab., ikusezintasun horrek ekipamenduen kudeaketa, mantentze-lanak eta berreraikuntzaren zailtasuna areagotu du.

(4) kudeaketa sistema. Kudeaketa sistema eta metodo eraginkorren faltak farmazia-ekipoen mantentze-lanetako langileen kudeaketa ez da nahikoa, mantentze-lanetako langileen lanaren estandarizazio falta, farmazia-ekipoen kudeaketa eta mantentze-prozesuen segurtasun-arrisku ezkutuak uzten ditu.